Dua setengah tahun setelah 〈Lost July〉 yang melibatkan seluruh dunia dan menghancurkan satu kota. Meryl, yang telah menjadi reporter senior, melanjutkan pencarian Vash bersama juniornya, Milly, dan bertemu kembali dengan Nicholas. Mereka merasakan bayangan faksi Millions Knives di balik serangkaian insiden perampasan Plant yang mulai terjadi lagi.
Sementara itu, Vash, yang diam-diam tinggal di kota terpencil dengan nama Eriks, didatangi oleh seorang gadis, Jessica, yang menyampaikan sinyal SOS dari Kapal Ketiga “Home”. Vash bertekad memutuskan nasib buruknya demi melindungi orang-orang yang berharga baginya—
Ketika takdir masing-masing kembali terjalin dan cerita kembali bergerak, sebuah komunikasi datang dari luar angkasa: “Kami adalah armada kapal imigran dari Bumi. Mereka yang berharap, dapat pergi bersama kami menuju tanah harapan yang baru—.”
Kegembiraan dan semangat berkobar di mana-mana. Namun, seolah mengolok-oloknya, Malaikat Bersayap Satu yang bangkit kembali membawa keputusasaan dan ketakutan. Di planet yang telah berubah menjadi kancah kegilaan, nasib akhirnya akan ditentukan.
lah ada lanjutannya ni anime 3d tapi lupa gw cerita trigun stampede endingnya gimana