Tiga puluh tahun yang lalu, dunia nyaris hancur akibat kemunculan makhluk asing misterius yang dikenal sebagai Spesies Asing Invasif. Sejak saat itu, umat manusia dan makhluk yang disebut Spesies Invasif ini terus bertarung memperebutkan wilayah kekuasaan. Meski saat ini keamanan umat manusia mulai stabil, dunia masih berada di ambang kehancuran yang bisa terjadi kapan saja. Di tengah ketakutan akan kematian dan kepunahan, orang-orang menjalani keseharian mereka sembari memalingkan mata dari bahaya dan bencana yang mengintai.
Di dunia yang rapuh ini, badan investigasi makhluk berbahaya PBB, “EXCEEDS”, memulai operasinya untuk menghalau krisis dan bencana yang disebabkan oleh para Spesies Invasif.
Kisah bermula di Mizuho, sebuah negara kepulauan di ujung timur. Di sebuah pulau terpencil, hiduplah seorang gadis pembasmi Spesies Invasif bernama Shiina Kuze. Shiina hanya ingin hidup dengan tenang bersama satu-satunya keluarga yang ia miliki, adiknya, Setsuna. Namun, sebuah insiden besar datang menghampirinya—insiden apakah itu?
